PCR(Polymerase Chain Reaction)即聚合酶链式反应是一个强大的分子生物学技术,用于扩增特定的DNA片段。PCR反应指在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以特定引物为延伸起点,体系中加入dNTP、Mg2+以及延伸因子、扩增增强因子,通过变性、退火、延伸等步骤,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA的过程,能快速特异地在体外扩增任何目的DNA。PCR反应将微量目的DNA片段扩增一百万以上,它以敏感度高,特异强,产率高,重复好,以快速简便优点迅速成分子生物学研究中最为广泛的方法。
PCR反应的成功依赖于五个关键要素:
1. 引物:
1) 引物是一段短的DNA序列,用于与目标DNA模板的特定区域配对。
2) 设计原则包括长度(1530 bp)、G+C含量(40%60%)、避免二级结构和引物间互补等。
3) 通常每条引物的浓度为0.10.5 μmol/L,过高可能导致非特异性扩增。
2. 模板DNA:
是待扩增的DNA序列,可以是基因组DNA、cDNA或质粒DNA。
数量和纯度对结果至关重要,通常使用102105拷贝,但过量可能增加非特异性产物。
单链和双链DNA均可作为模板,但线性DNA比环状DNA扩增效果更好。
3. DNA聚合酶:
1) 负责催化DNA合成,常用的是Taq DNA聚合酶,因其耐高温特性。
2) 其他如Pfu、Phusion等酶具有更高保真度,适用于特定应用。
3) 酶的浓度通常为1.02.5 U/100 μL反应液,过高或过低均影响扩增效率。
4. dNTPs(脱氧核苷三磷酸):
1) 作为DNA合成的原料,通常等量加入反应体系,终浓度为20200 μmol/L。
2) 浓度过高可能抑制Taq酶活性,影响产物特异性。
5. Mg2+:
1) 作为DNA聚合酶的辅助因子,影响酶活性和产物特异性。
2) 终浓度通常为0.52.5 mmol/L,需要根据引物Tm值和dNTP浓度调整。
此外,PCR反应还需要缓冲液提供适宜的pH和离子环境,以及适当的温度控制(变性、退火、延伸三个阶段)来完成循环扩增。
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