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菌落计数是微生物实验中普遍的实验之一，是统计物品含菌数的有效方法，广泛用于食品、饮料、药品、生物制品、化妆品、卫生用品、饮用水、生活污水、工业废水、临床标本中细菌数的检验。
类别
半自动菌落计数器
菌落计数器是一种数字显示式自动细菌检验仪器。由计数器、探笔、计数池等部分组成，计数器采用CMOS集成电路精心设计，LED数码管显示，字高13mm，清晰明亮，配合专用探笔，计数灵敏准确。黑色背景式记数池内，荧光灯照明，菌落对比清楚，便于观察。
对于精确度要求不高的用户，可以考虑手动的或者半自动的菌落计数器。手动的价格比较便宜，市场价大约都在800-1200元，稍微好点的，是半自动的带有语音读报功能的，放大倍数在3级以上的，市场价要2500元左右，这种已经能够满足大多数用户的计数要求。而对于要求较高的预算充足的用户而言，具有全自动技术功能且带有菌落分析、测量、分类等的全自动菌落计数/分析仪更能符合他们的需求。
全自动菌落计数/分析仪
全自动菌落计数仪 因其使用的自动化程度高、分析结果可核对、样品信息可留存等，已逐渐被越来越多的科研院所、卫生疾控部分所喜爱。全自动菌落计数仪采用成像分析法实现自动计数，即由【成像硬件+分析软件】所组成。
成像硬件用于获得清晰有效的菌落图像，以便分析计数。成像硬件有拍照成像、扫描成像。由CMOS加摄像头拍照成像的优点是：成像速度快，能展现培养基表层和深层的细微菌落。确保在0.5秒内获得菌落图像。由单反相机、卡片机拍照成像的优点是：能自动对焦、且像素分辨率一般更高，但其成像需要3～4秒的时间。
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