/ 微生物分子分型实验数据分析技术服务

PFGE 以其重复性好，分辨力强而被誉为细菌分子分型技术的“金标准”。它可以用于大分子DNA的分离，其分辨范围达到10 Mb。PFGE选用识别低频率酶切位点的内切酶切割基因组DNA，获得的DNA大片段在外加脉冲电场的低浓度琼脂糖凝胶中分离，产生数量有限的DNA条带，在凝胶上按染色体片段长度的不同而呈现出电泳带型，从而实现对菌株分型以检测菌株的基因多态性。

MLST 是基于细菌核苷酸序列比对的一种分子分型方法，其原理是通过比较细菌个体7个或者更多管家基因的核苷酸序列的多态性，确定其基因多态性，同时通过划分序列群和构建最小生成树来揭示细菌群体遗传结构。

MLVA 是基于细菌基因组中多个位点的数目可变化的串联重复序列核心序列的拷贝数的差异来对不同细菌个体进行分型的一种技术。MLVA具有快速高通量易于操作等优点，不仅能确定基因多态性，而且能揭示细菌群体遗传结构特征。

使用PFGE、MLST、MLVA中的一种或者综合使用多种分型方法，可以揭示细菌的基因多态性和群体遗传结构，结合细菌的三间分布信息以及其他生物学信息（如耐药特征、特殊表型、毒力基因检测）等可以进行细菌的流行特征、传播机制、变异特征分析，以及特殊意义克隆群的甄别等研究；另外还可以为后续的研究，如全基因组测序、致病机制研究等项目筛选具有基因组代表性的测试菌株。

另外，我司还提供其它分子分型服务，例如ERIC-PCR、RAPD等，以及宏基因组、耐药基因谱、毒力基因谱检测和数据分析等技术服务。

数据分析服务内容：

• PFGE typing

• RiboPrinter typing

• MLST analysis、MLVA typing

• MALDI、AFLP、RFLP、RAPD

• REP-PCR、ARDRA、DGGE、TGGE

• Whole genome MLST

• Antibiotic resistance profiling

• Community fingerprinting

• Hetero-Duplex Analysis (HDA)

• HIV drugresistance prediction

• ISSR-PCR using QIAxcel

• ITS typing

• MIRU-VNTR typing

• MLPA analysis

• Molecular surveillance

• Sequence-based typing

• Sequence repeat typing

• spa-typing

• Taqman-based SNP genotyping